1.3 RT-PCR
cDNA第一链的合成(Boehringer Mannheim产品):使用20μl体系,主要包括以下成分:反应缓冲液、10mmol/LdNTP、1μgtotalRNA(0.1μgm RNA)、50U RNase inhibitor、50UAMV反转录酶、1.6μgoligo(dT)15引物。于42℃反应30分钟,99℃5分钟终止反应。PCR(TaKaRa产品):建立100μl的反应体系,主要成分如下:反应缓冲液、10mmol/LdNTP、引物(上、下游引物终浓度均为0.2μmol/L,引物序列见附表)、2~3μlcDNA产物、5UTaqDNA聚合酶。95℃10分钟预变性,反应40个循环,每循环94℃、60℃、72℃各1分钟,最后一个循环72℃保温10分钟。
附表 RT-PCR扩增中使用的引物序列
mRNA | 产物(bp) | 引物(5′→3′) |
MUC1 | 288 | CGTCGTGGACATTGATGGTACC GGTACCTCCTCTCACCTCCTCCAA |
Keratin19 | 460 | AGGTGGATTCCGCTCCGGGCA ATCTTCCTGTCCCTCGAGCA |
β-actin | 300 | CTTCGCGGGGCGACGATGC CGTACATGGCTGGGGTGTTG |