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聚合酶链反应与常规方法检测牙龈卟啉单胞菌的比较研究

  来源:120online      日期:2007-05-07
中华口腔医学杂志2000年第1期第35卷论著作者:金笑一 杨圣辉 王申五 刘红 张春梅单位:金笑一(首都医科大学附属北京口腔医院综合科 100050 北京);杨圣辉 张春梅(口腔医学研究所);王申五(北京医科大学附属人民医院中心实验室);刘红(北京医科大学附属人民医院中心实验室)关键词:聚合酶链反应;卟啉类;基因...

  6.间接免疫荧光法:采用杨圣辉等[3]报道的检测方法。

  7.PCR法:

  (1)细菌DNA的提取:将混悬于装有0.1 ml生理盐水的 Ep管中的临床样本 ,在旋涡混合器上震荡混匀 ,弃上清 ,加入25 μl细菌裂解液(50 mmol/L KCl, 10 mmol/L Tris-HCl, pH7.6, 2.5 mmol/L MgCl2, 0.1 μg/L明胶, 0.45% NP-40 , 0.45 % Tween 20)及蛋白酶K 10 μg/L,混匀,置于55 ℃水浴2 h,100 ℃10 min,0 ℃10 min,10 000 rpm离心 10 min ,保留上清,待用。

  (2)PCR扩增 :总反应体积为25 μl,5×Buffer缓冲液5 μl,2.5 mmol/L dNTP(含4种脱氧核苷酸)2.0 μl, TaqDNA聚合酶1 μl(0.5 U/μl)、引物(P1, P2)各12.5 pmol/μl , 细菌DNA提取液1 μl,加三蒸水至25 μl,混匀后加10 μl石蜡油。反应按预变性 94℃4 min,变性 94℃ 45 s,退火 56℃45 s,延伸至72℃ 60 s, 经30个循环后,延伸72 ℃ 5 min。

  (3)检测扩增产物 :取扩增产物10 μl,2.0%琼脂糖(0.5 mgEB/L)凝胶电泳,以PBR322DNA/BSTNT为参照物,紫外灯下观察[4]。如扩增产物与对照组产生相同的特异性扩增带,则表明为PCR阳性标本,否则为阴性标本,见图1。设置对照组:①ATCC33277为模板作阳性对照; ②加除ATCC33277模板以外的PCR系统所有其他成分;③加ATCC33277模板,但不加引物; ④分别以92样本DNA为模板。

1 PCR扩增P.g特异性片段临床标本凝胶电泳图谱

  结果

  1.培养法、间接免疫荧光法及PCR阳性检出率结果:见表2。可看出PCR检出率最高。

表2 培养法、IF法及PCR法P.g阳性检出率(%)

表3 PCR和培养法分析阳性结果比较

  PCR与间接免疫荧光法的比较结果见表4。经卡方检验, PCR法显著高于荧光法,P<0.001。相关性检验表明,两种方法呈显著相关, P<0.01。

表4 PCR和IF分析阳性结果比较

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