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甄氏外瓶霉的PCR-RFLP分型研究

  来源:120online      日期:2007-05-07
中华皮肤科杂志2000年第5期第33卷论著作者:李东明 李若瑜 王端礼 王晓红 马圣清单位:100034北京大学第一医院皮肤科关键词:甄氏外瓶霉;随机扩增多态DNA技术...

  图2甄氏外瓶霉聚类分析树状图

  讨论

  甄氏外瓶霉是一组较为复杂的群体,目前认为其包括3个变种:E.jeanselme ivar.jeanselmei;E.jeanselme ivar.heteromorpha;E.jeanselme ivar.lecanii-corni。外抗原实验显示有3种血清型;DNA杂交将其分为6型[5],其中1、2、3型为血清Ⅰ型,4型为血清Ⅱ型,5、6型与血清Ⅲ型相一致;线粒体DNARFLP分析则将45株甄氏外瓶霉分为15型,但作者未标明与血清型的关系[6]。从以上实验可见,甄氏外瓶霉并非单一的种,而是种的复合体,分型较为复杂。

  核糖体DNAPCR分型早已用于真菌种及种以上水平的分类,其转录间隔区(ITS)在核糖体DNA中进化较快,可以在同一属间甚至群体间发生变化。资料表明,ITSⅡ区在种内变异性较低(<3%),种间变异性较高(约22%)[7,8]。引物ITS3位于5.8SrDNA5′端,ITS4位于25SrDNA5′端,用该对引物得到的扩增片段包括5.8SrDNA大部分序列及完整的ITSⅡ区,约为330bp左右。

  本实验中,15株菌可分为6型,多数菌株(13株)具有较近的亲缘关系(SM>0.7),型内相似程度较高,各变种间差异较大,SM值在0.5左右,与种间SM值相似。此结果还与18SrDNA分型和ITS1-ITS4分析的结果一致[9,10]。本研究支持3个变种应分属于不同种的观点。我们还发现同属变种E.jeanselme ivar.heteromorpha的BMU00457与BMU00010酶切带型差异较大(SM=0.51),前者与模式株BMU00001具有较高的亲缘关系。对于该变种的划分,还有商榷的余地;BMU00195分离自我国1例神经系统暗色丝孢霉病患者的病损组织,加拿大和美国学者将其鉴定为E.jeanselme ivar.lecanii-corni。1997年,ATCC将其收录为E.jeanselme ivar.lecanii-corni,并编入其菌种目录(编号为ATCC201307)。本实验中,此菌与同一变种的BMU00480(ATCC12734)差异极大,4种酶切图谱有3种不同,与其它菌株相似程度亦较低。在包括其它菌种的所有受试菌株中,只有该ITSⅡ序列能被HinFⅠ识别,提示该菌有可能为新变种或者为新种,但尚有待于进一步深入研究其多方面的特性。

  志谢日本千叶大学真菌医学研究中心为本实验提供了部分受试菌株;中国科学院微生物研究所黄河研究员、刘小勇硕士在实验方法上给予了帮助

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