再者与现代科学交融，选择突破口，揭示科学内涵。中医基础理论体系是中国传统文化的再现，也就是“务本”与“兼容”的关系。“务本”就是尊重中医自身发展规律，遵循中医基础理论体系。在这一前提下，采用现代科学诠释基础理论，揭示科学内涵。他认为，融入新知去揭示基础理论科学内涵的突破口应当选择：运用多学科新知包括声、光、电、物理、化学等多方面知识去研究中医的“气化理论”，并进而揭示“象”系统的生命运动规律，藏象理论的现实意义也就显而易见。
第四，建立创新机制。科学的发展要依赖创新，而创新是推动科学发展的动力，所以中医基础理论研究要取得成果就必须建立创新机制。具体而言，其一鼓励在符合中医自身发展规律前提下，运用多学科研究方法去研究，揭示中医基础理论的科学内涵；其二，以人为本的观念，给研究者（个体）以充分实行自我意志的环境和发挥创新潜能的条件；其三，“为人所不能”是竞争中取胜的关键，鼓励研究者以创新的特色，从而在“想入非非”、“异想天开”之中显现出创新的闪光点，选择有兴趣而又有可能成功的选题。其四，建立创新标准包括评估质量标准。
又见一年春草绿，春风扑面向未来。程昭寰强调，要从教育入手，多读经典，以史为鉴，对中医基础理论研究中的思维发展、理论内容、性质、研究对象等进行梳理，清除糟粕，发扬精华。与此同时，我们也应正视现实，面向未来，改变中医基础理论研究的现状。他建议，主管中医药事业的决策者们，多为中医基础理论研究创造一些条件，并提出一些解决办法。他坚信，如果大家同心同德为中医药事业勤勉奋力，未来的中医基础理论研究必将取得丰硕的成果。 B27
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