① 琼脂糖凝胶电泳染色法：
取扩增产物10μl点样于2%琼脂糖凝胶中， 70V电泳15-20min,溴化乙锭染色5min，于紫外灯下观察结果,在溴酚兰后面有一条，或二条亮红条带为阳性结果, HSV-2带在前，HSV-1带在后，无带则为阴性结果。
② Southern印迹法：
PCR产物20μl 经电泳分离后，用变性液处理60min，再用中和液处理90min，转移至硝酸纤维素膜上，80℃烤膜2h，42℃预杂交(杂交液中)30min，加入32P标记HSV探针后，42℃杂交过夜，次日用1%SDS/PBS pH7。2，42℃洗15min，0.5%SDS/PBS pH7.2，42℃洗15min；膜置X线暗盒内，放射性自显影12-15h，，显影为阳性，不显影为阴性。
(三)、聚合酶链反应—酶谱法(polymerase chain reaction-endonuclease cleavage PCR-EC)
具有经济广泛等特点；不仅能一次性分型检测HSV-1，HSV-2，EBV，CMV四种病毒，而且方法本身快速、方便、无放射线损伤，易被实验室接受。可检出3个CFU的HSV1，灵敏度高，能检测出中枢神经系统感染第1dCSF中HSV DNA阳性结果，并可用于药物治疗效果的评价。由于病毒的变异性，会出现酶切点突变丢失现象，从而造成酶切阴性结果。对此可以通过型特异性探针或序列分析解决。
1. 标本处理
(1)标本采集，方法同上。
(2)DNA模板制备：每份标本取200μl，按200μg/ml加入蛋白酶k，56℃作用1h；
加入等体积的酚—氯仿(v/v)轻摇10min，离心1000r/min×5min；取水相加入500μl(2.5倍体积)无水乙醇，-20℃过夜沉淀DNA，离心15000r/min×5min,吸去液体，30℃干燥后,加蒸馏水25μl溶解, 待检。
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